本实用新型涉及一种离心萃取机芯轴用液体密封结构及离心萃取机，该液体密封结构设在离心萃取机的壳体上盖板和轴承座之间，离心萃取机还包括芯轴，且芯轴垂直穿过轴承座和壳体上盖板伸入离心萃取机内部，液体密封结构包括设在壳体上盖板上端面的凹槽，凹槽沿壳体上盖板的上端面周向设置、且凹槽的上端与轴承座连接，凹槽内设有液体密封室，液体密封室内设有液体密封介质，轴承座下部开设有与液体密封室连通的、供液体密封介质进入的进液口。如此，能够实现无气体泄漏，不仅能够满足密封要求，避免了机内料液中易挥发性物质挥发到离心萃取机外部造成物料浪费和环境污染，而且克服了上述传统密封技术中的各种不足之处。