本发明涉及上下双支撑式离心萃取机领域，特别涉及上下双支撑式离心萃取机的下轴承座的密封，提供了一种上下双支撑式离心萃取机的底部密封结构，底部密封结构包括外壳，外壳的顶、底部分别设有供转鼓转轴的上、下轴头部分转动支撑的上轴承座和下轴承座；还包括环形隔离座，环形隔离座固定在外壳上且位于下轴承座的上方，或者环形隔离座由下轴承座形成；环形隔离座上连接有密封套管，密封套管的底端与环形隔离座的连接处为密封结构，密封套管的顶端伸入转鼓内；转鼓转轴的下轴头部分从密封套管中穿过，与密封套管之间形成环形间隔；密封套管与环形隔离座共同形成隔离结构。上述方案能够解决现有的上下双支撑式离心萃取机的底部密封困难的问题。