本实用新型涉及一种生物科技用菌袋刺孔装置，用于生物科技菌袋处理，该生物科技用菌袋刺孔装置包括支撑架，支撑架顶部的内侧固定安装有电推杆，电推杆的输出端固定安装有固定板，固定板的下表面固定安装有若干固定杆，固定杆的底端固定安装有限位块，固定杆上转动套接有套管，套管的外壁固定有连接板，连接板的另一侧固定安装有刺孔模块。本实用新型中，通过螺栓可以将自由转动的套管固定在指定位置，使得套管通过连接板连接的刺孔模块的位置可以根据不同菌袋的刺孔需求得到有效调整，从而更好的满足对不同菌袋的刺孔处理，使得该装置的实用性得以增强，且刺针在使用时，需要通过挤压弹簧从套筒中推出，使得刺针的使用更加安全。