本实用新型公开了一种利用微生物处理禽畜粪尿发酵分离装置，包括分离箱，分离箱的顶端贯穿底端开设有分离腔，分离腔的腔底贯穿分离箱下底开设有若干过滤孔，分离腔的两相对内腔壁均贯穿分离箱外侧壁开设有条形孔，分离箱的两侧固定安装有驱动机构，驱动机构包括四个固定块，四个固定块分别固定安装在分离箱两相对外侧壁的端部，在两个螺纹筒之间安装辊筒，实现辊筒的线性移动，能够往复运动在整个禽畜粪尿分离工作面上，初步提升固液分离效果，通过拨条能够翻滚禽畜粪尿，减小固态粪便堵塞过滤网孔的几率，从而进一步的提升固液分离效果，并且还能藏匿在固态粪便内的少量尿液剥离出，更加进一步的提升固液分离效果。