本实用新型公开一种益生菌饮品加工用的菌种检测取样装置，涉及益生菌检测领域。该益生菌饮品加工用的菌种检测取样装置包括取样筒，所述取样筒的底部为设有取样头，所述取样筒的内部设有活塞，所述活塞与取样筒滑动连接，所述取样筒的上方设有固定架，所述固定架上且靠近中心处设有活动杆，所述固定架的底部且位于取样筒的外侧焊接固定有三组环形阵列分布的套管，所述套管的内部设有支撑杆，所述支撑杆与套管滑动连接。该益生菌饮品加工用的菌种检测取样装置，可自由选择不同容量规格的取样筒进行定量取样，并对取样筒进行密封，防止样品出现泄露，避免菌种因沾染灰尘而受到污染，从而方便对菌种进行检测。