本实用新型公开了一种样本篮运送系统，样本篮运送系统包括：运送轨道，用于输送样本篮，运送轨道在第一平面内沿预设轨迹延伸，且运送轨道的输送路径上设置有插片工位；顶升装置，安装于插片工位，顶升装置用于将到达插片工位的样本篮向第一方向抬升，以使样本篮脱离运送轨道。本实用新型提供的样本篮运送系统，运送轨道将样本篮输送至插片工位后，利用顶升装置能够抬升样本篮并使样本篮脱离运送轨道，使得运送轨道可以继续运行，运送轨道的运行也不会影响样本篮的定位，因此后续插片作业能够稳定进行。