本发明提供一种玻璃基液晶相位调制装置及制备方法，所述装置包括上基板与下基板，以及设于两者之间的液晶层，上基板包括上玻璃基板和公共电极；下基板包括下玻璃基板以及自下玻璃基板朝向液晶层一侧设置的第一薄膜晶体管、第二薄膜晶体管及有机平坦层；有机平坦层朝向液晶层的一侧依次设有第一像素电极、第一钝化层及第二像素电极，所述第一像素电极与所述第二像素电极相互交错设置。解决了现有技术中玻璃基液晶相位调制装置的开口率难以提高，导致降低相位调制光利用率，以及缝隙偏大形成高阶衍射产生杂光的技术问题。