本发明公开了一种抗菌纳米颗粒及其制备方法和应用。本发明的抗菌纳米颗粒的组成包括玉米醇溶蛋白纳米颗粒和包裹的多酚‑金属配位化合物，多酚‑金属配位化合物由多酚和铁盐进行配位反应得到。本发明的抗菌纳米颗粒的制备方法包括以下步骤：1)将玉米醇溶蛋白通过反溶剂法制成玉米醇溶蛋白纳米颗粒；2)将玉米醇溶蛋白纳米颗粒加入多酚水溶液中，进行反应，得到多酚修饰的纳米颗粒；3)将多酚修饰的纳米颗粒加入铁盐溶液中，进行配位反应。本发明的抗菌纳米颗粒在近红外光照射下可以通过光热效应快速产生高温，达到短时广谱抗菌效果，生物相容性好，且其制备原料绿色天然、无毒害，在食品抗菌、医疗抗菌等领域具有广阔的应用前景。