本发明公开了一种再生纸制造技术领域的一种再生纸清洁系统及其控制方法，旨在解决现有技术中水资源的浪费、生产过程中产生腐浆、臭味等问题。所述清洁系统包括：制浆池、成浆池、流浆池、纸张成型系统、水循环系统；所述纸浆池通过第一管道连接于成浆池；所述成浆池通过第二管道连接于流浆池；所述流浆池通过第三管道连接于纸张成型系统；所述第一管道与制浆池连接处的第一接口与所述第三管道与纸张成型系统连接处的第二接口通过第四管道连接；所述水循环系统的进水管和出水管分别与所述第四管道连接。本发明适用于再生回收纸制造生产的质量，能够保护水资源的有度使用，减少生产过程中管道产生的腐浆、细菌及臭味等。