本申请公开了一种药学知识图谱构建方法和装置，该方法包括以下步骤：获取多个药学数据源中的药学数据，以药学领域中的概念和术语为基础，参考权威数据源中的数据表示方法和层级关系，结合生物医学本体库，并根据多个药学数据源中的药学数据格式和药学数据内容，构建药学本体模型；根据药学本体模型，构建关系数据模型和图数据模型，生成关系数据与图数据之间的映射关系；将多个药学数据源中的药学数据导入与关系数据模型对应的关系数据库，将每个药学数据源中的药学数据作为独立的数据库存储；根据关系数据与图数据之间的映射关系，将关系数据库中的关系数据转换为图数据，并将图数据导入与图数据模型对应的图数据库，生成药学数据的知识网络。