本申请提供一种船用甲醇燃料供给系统和方法，所述系统包括：通过甲醇燃料供给管路依次串接的甲醇储罐、甲醇供给单元、燃料阀组单元、甲醇发动机以及甲醇回收单元；且所述甲醇回收单元又回接到所述甲醇储罐，所述甲醇回收单元包括依次串接的回液主阀、第二流量计、热交换器和温度变送器，所述甲醇发动机通过前端回液管路与所述回液主阀相连，所述温度变送器通过后端回液管路与所述甲醇储罐相连。本申请所述船用甲醇燃料供给系统和方法，通过甲醇回收单元，将未被甲醇发动机使用的甲醇燃料再回流至甲醇储罐，实现甲醇燃料的回收再使用，减少了甲醇燃料的浪费。而且本申请所述船用甲醇燃料供给系统设计简洁、安全性高。