本发明属于燃料供给设备技术领域，涉及一种船用甲醇燃料供给系统，包括甲醇源、第一换热器、混合筒、第二换热器、精滤器、热源、氮气源，甲醇源与第一换热器的甲醇入口连接，第一换热器的甲醇出口与混合筒连接，混合筒与氮气源连接，混合筒的出口与第二换热器通过混合物料管路连接，第二换热器的出口与精滤器连接，精滤器的出口通过输出燃料管路与后续的柴油机连接，第一换热器和第二换热器分别与热源连接。从甲醇燃料的供给为出发点，控制甲醇的流量、温度、压力及清洁度等参数使之符合发动机燃料要求，同时满足发动机启动、正常运行、停车等运行工况及安全性要求。减少船舶硫氧化物的排放。