本发明提供一种用于神经内镜的光纤探头系统，涉及医疗器械领域，以解决现有的神经内镜的光纤探头在使用的时候，无法便捷清洁光纤探头，无法暂时支撑光纤探头的问题，包括神经内镜与主体连接，主体内包含有激光发射器，主体的下线设有散射信号收集器，散射信号收集器的下线设有处理器，处理器的下线设有报警器；主体；所述主体为拉曼光纤探头本体，主体的外侧套装有受力件，主体的前端外侧套装有移动件。卡板的内端在导向槽的内部解除限位弹簧伸展推动受力件以及移动件向外移动，使刮件可以将光纤探头插入端进行刮取清洁，存储仓的内部添加医用棉花以及消毒液，移动件位移，消毒液可以与光纤探头插入端外侧接触，进而进行便捷的清洁消毒。