本发明涉及非同质化代币流通技术领域，具体公开了一种NFT原子交换方法、系统、计算机可读存储介质及终端设备，方法包括：NFT发货方构建NFT的最新原子交换交易；NFT发货方将该NFT的最新原子交换交易、该NFT对应的原始原子交换交易与最终原子交换交易之间的交易链条、最终原子交换交易中代表NFT的输出的默克尔证明发送给NFT购买方；NFT购买方在本地SPV进行该NFT的存在性验证、进行本地溯源；NFT购买方在确认该NFT的交易存在并且溯源成功后，在最新原子交换交易中填入输入和输出，并广播到全节点完成该NFT的最新原子交换交易。本发明保证了NFT交易的一致性，使得NFT交易可以不依赖任何可信第三方，且整个交易过程简单又高效。