一种基于聚焦离子束制备低阶褐煤HRTEM薄片样品的方法，包括以下步骤：在扫描电子显微镜模式下利用二次电子图像或者背散射电子图像找到目标尺寸大小的褐煤颗粒，并选取目标区域进行Pt层沉积；利用聚焦离子束对褐煤颗粒目标区域进行初构型挖坑切割得到褐煤初构型薄片样品；对样品依次进行减薄粗修和不对称凹型切割；利用纳米机械手对样品进行提取与固定；聚焦离子束低束流对褐煤样品进行切片抛光精修。该方法耗时短，能方便控制煤片的厚度，目标性强，能够实现对特定煤粒的原位观察；另外，该方法制备得到的薄片样品厚度薄符合HRTEM透射测试样品的要求，可使薄片在HRTEM下观察得到的图像清晰，芳香条纹显示效果显著。