本发明公开了一种基于海洋生态环境监测系统的样品采样监测实现方法，所述系统包括置于系统网页端的数据编码模块、数据采集模块、数据传输模块和数据分析模块，所述系统还设有手机接入端口，系统手机端经手机接入端口可以与数据编码模块、数据采集模块、数据传输模块和数据分析模块进行数据交换操作，所述样品采样监测实现方法包括样品采样任务编码生成步骤、样品采样任务接收验证步骤和样品采样任务执行步骤。本发明采用数据编码形式下发任务信息，仅数据编码信息能被操作终端所了解，做到了采测工作留痕质控，通过这种方式保障了监测数据的真实性、准确性和完整性，提高了海洋生态环境监测效率，完善了国家的海洋环境监测体系。