本发明公开了一种基于遗传算法的鬼成像方法、系统及存储介质，方法包括以下步骤：指定散斑个数，随机生成初始散斑；将初始散斑随机分为两组，通过交叉变异产生子代散斑；将初始散斑中的亲代与子代散斑与目标进行作用，得到相应的桶探测信号；以桶探测信号和散斑相关性为依据挑选指定数量的散斑，作为优化后的随机散斑；使用优化后的随机散斑与对应的桶探测信号重建图像。对应成像方法，本发明鬼成像系统包括初始散斑生成模块、子代散斑生成模块、桶探测模块、散斑挑选模块以及图像重建模块。本发明可以在同等采样率的情况下，获取相较于直接使用大量随机散斑更高质量的目标图像。