本发明涉及一种行播水生植被冠层反射的蒙特卡罗计算机模拟方法，其步骤如下：根据行播植被的几何结构、行向和行距特征构建出水生植被的三维场景，在一垄内叶片均匀分布；模型耦合了植被叶片的光谱模型用于计算叶片的反射率和透过率；耦合了波浪水面反射模型用于计算水面反射和透射分布；耦合了浅水生物光学模型来计算背景水体的吸收系数和散射系数；根据光照分布随机生成大量的入射光子，追踪每个光子在模拟场景中完整的传播过程，记录出射方向，根据出射光子的统计分布计算得到整个水生植被冠层的反射率。该发明将为水生植被冠层生理生化参数遥感监测提供新的模型工具与技术方法，同时为行播作物的精准化水肥调控管理提供科学依据。