本发明公开了一种轨道车辆储能系统充电方法，该方法采用至少两套储能系统并联供电，每套储能系统均配备有电芯管理系统CMS；采用的充电桩系统与储能系统上的电芯管理系统CMS之间无线双向通信连接；充电桩系统在给储能系统充电之前，先判断每个储能系统的电压之间是否存在不适合同时充电的电压差，若不存在，则控制充电桩同时对每个储能系统进行充电；若存在，则将各储能系统的电压调节到适合同时充电的电压差后再控制充电桩同时对每个储能系统进行充电；具体充电过程中先用恒流充电，直到储能系统电压稳定后再换成恒压充电，到储能系统电流稳定后，结束充电。该方法具有包含多个储能模块，充电安全性、稳定性与充电效率可以兼顾的效果。