本发明属于涂层技术领域，具体涉及一种透明导电薄膜的制备方法及其应用，本发明的透明导电薄膜的制备方法包括步骤一、采用等离子体改性碳纳米管，对碳纳米管表面进行氨基化改性处理；步骤二、将改性后的碳纳米管与水和分散剂混合均匀，配制成碳纳米管浓度为5‑50ppm、粘度为1‑10cps的碳纳米管墨水；步骤三、采用等离子体改性透明基材，对透明基材表面进行亲水改性处理；步骤四、采用微电子喷墨打印机将步骤三制得的碳纳米管墨水打印于经等离子体表面处理后的透明基材上，使透明基材上形成薄膜，对薄膜进行干燥处理，得到透明导电薄膜。本发明的透明导电薄膜的制备方法工艺简单，可制得高导电性和高透光率的薄膜。