本发明的一种水产苗种智能养殖系统，包括箱体，设置在箱体中央的增氧装置，其包括增氧管、中空筒体、滤材和增氧盘，所述的增氧管竖直伸入箱体的底部内，所述的滤材位于增氧盘和中空筒体的外周面之间；过滤箱，其固定设置在箱体的顶部且位于增氧装置的上方，在过滤箱内固定设有用于过滤所设的滤芯，过滤箱的底部与增氧盘底部相接、顶部与外部供水设备管连接以此对箱体内进行供水；具有称重传感器的喂食器，喂食器的出料端位于箱体内；光源组件，其包括控制器、与控制器通讯连接的光敏电阻传感器、补光灯芯片、安装在箱体顶部内壁上的若干排灯珠和安装在灯珠上的光学级聚光透镜；其结构设计合理。