本发明提供一种超长纳米线和超长纳米线异质结材料的加工方法和装置。本发明包括纳流控芯片和反应控制系统，纳流控芯片包含纳米尺寸的液流通道结构和微米尺寸的液流通道结构，纳米液流通道的两端分别和两个微流通道相连，微米液流通道通过芯片储液池接口和外部液流控制系统相连，反应控制系统包括所述外部液流控制系统、反应辅助温控系统和离子直流驱动系统，辅助温控系统用于调节纳流控芯片中的反应温度，外部液流控制系统用于将外部溶液以预设的速度注入微流控芯片的微流通道中，离子直流驱动系统用于对施加在微流通道上的电场进行精准的控制，该电场用于控制进入纳流通道中离子的数量和合成反应过程的速度。本发明实现超级纳米线异质结的合成。