本发明提供一种法布里珀罗传感器的噪声抑制系统及方法，包括，光源调制模块通过波形发生器和激光驱动器将光信号调制到高频后通过分光镜分成信号光束和参考光束，信号光束通过法布里珀罗传感器将低频加速度信号调制到高频后和参考光束同时进入参考PD降噪模块。通过参考PD降噪模块将信号光束中的噪声信号通过差分运算去除，保留调制信号和调制信号边带上的加速度信号。同时，由于降噪电路具有高通滤波器特性，因此不会对调制信号进行抑制。将噪声去除后的信号和波形发生器发出的调制信号输入解调模块进行解调，这可以将低频加速度信号从调制信号的边带上还原出来，最终实现参考PD降噪电路在低频领域应用的目标。