本发明属于船舶检测技术领域，公开了包括数据预处理单元、数据库单元、数据可视化单元以及船舶轨迹异常检测单元；所述的方法包括如下步骤：初始化船舶轨迹异常检测系统，建立异常检测模型；获取并存储船舶轨迹数据；根据船舶轨迹数据进行船舶轨迹可视化展示；对船舶轨迹数据进行预处理，得到并存储预处理后数据；将预处理后数据输入异常检测模型进行船舶轨迹异常检测，得到并存储异常检测结果；根据异常检测结果进行异常轨迹可视化展示。本发明解决了现有技术存在的人力及时间成本投入大、工作量大、工作要求高、由于天气原因导致的精确性低以及检测步骤复杂的问题。