本发明涉及一种养殖场沼气热电联供系统优化方法及系统。所述方法包括：构建供能侧热量模型和热需求量模型；供能侧热量模型表示提供的热量与用于沼气发电的沼气量和进料量之间的关系；提供的热量包括：发电机提供的热量和锅炉提供的热量；热需求量模型表示厌氧发酵罐的热需求量与进料量之间的关系；根据供能侧热量模型和热需求量模型确定热需求量约束模型；以热需求量约束模型、发电机组功率约束模型、燃气锅炉功率约束模型和用于发电的沼气量约束模型为约束条件，以投资收益率最大为目标函数构建供热模型；对供热模型采用遗传算法进行求解得到最优个体，根据最优个体对养殖场沼气热电联供系统进行控制。本发明可以更好实现节能减排效果。