本发明提供了一种真菌毒素检测探针及试剂盒、一种真菌毒素的检测方法，属于真菌毒素检测技术领域。本发明提供的真菌毒素检测探针包括核‑壳三维结构的磁核多层量子点复合纳米材料和与负载于所述核‑壳三维结构的磁核多层量子点复合纳米材料表面的真菌毒素抗体。本发明利用Fe₃O₄磁性纳米颗粒作为内核，其对外部磁场的强磁响应性，能够赋予探针良好的磁分离特性，利用磁分离技术，可以省略复杂的样品预处理方法，快速实现待测样品的浓缩，避免样品损失，从而提高检测灵敏度，减少分析时间。本发明在内核表面包裹两层水溶性聚合物，每层水溶性聚合物表面分别负载有羧基化量子点，能够使探针在复杂样品中具有良好的稳定性以及生物相容性。