本发明公开了一种高效拦截消纳径流氮磷的坡地生态沟系统，包括主排水沟和消纳区，消纳区高处设有进水口、低处设有出水口，主排水沟与进水口前端相连段的沟底逐渐下沉至进水口底部以构成沉降面，进水口的后壁竖直向上延伸直至主排水沟底面以构成挡水面，出水口设有过滤装置用于拦截径流颗粒污染物及垃圾，消纳区内栽种有消纳径流氮磷的水生植株，消纳区底部铺设有用于固根、吸附悬浮物颗粒的卵石层，并能通过定期更换水生植株保持径流氮磷的消纳能力，有效拦截中小雨径流或暴雨前段径流，从而拦截消纳氮磷污染物，避免面源污染，具有预防水土流失、泄洪效果好、拦截消纳氮磷效果显著、美化环境、保护农田生物多样化的特点。