本发明公开一种基于银联平台的车辆收费方法及系统，首先通过车辆用户与银联平台签约并按照终端设备，从高速路网中心获取车辆通行费用账单；并生成借款数据并发送扣款指令到银行；然后从与银联平台关联的资方账户中将通行费用账单支付到高速路网中心指定账户，并在与终端设备关联的车辆用户的账户中进行扣款，以及将扣款信息发送到银联平台；以及车辆用户再进行还款，本发明提供的方法，可以采用日结或周结或者其他时间段结算方式进行账款清算，简化了缴费过程，且避免由于频繁缴费造成的缴费失败现象的发生。同时，基于银联平台的车辆收费方法中设置的还款流程，不仅快速结算通行过程产生的费用化，而且还可以简化解除由于逾期造成的状态名单的影响。