本发明提供一种工序物流调度方法及系统，包括：采用基于趋向性邻域搜索的多目标群体智能算法进行调度优化，包括：种群初始化步骤：构建种群中个体的染色体构建，对种群中所有个体进行初始化操作；变异操作步骤：通过随机改变染色体上的某些基因来生成新的个体，构成子代种群，增加整个种群多样性，拓展搜索空间，包括互换变异或逆序变异；选择操作步骤：模拟自然选择中适者生存的特性，通过计算解种群的中每个个体的目标函数值，获得该个体的适应度值，并使适应度良好的个体在迭代中留存下来，同时保持种群的大小恒定。本发明能够保证染色体设计与工艺过程的相符性，同时保证种群进化的群进化的有效性，编码简单、规则简单，且易于操作。