本发明涉及通信技术领域，尤其涉及一种基于代理客户端并行调度的方法及系统。所述方法包括以下步骤：调度系统服务器通过客户端调用官方客户端服务器进行批量作业；构建官方客户端服务器和代理客户端服务器之间的映射关系；官方客户端服务器通过代理客户端发送端调用代理客户端服务器进行批量作业；代理客户端服务器通过代理客户端接收端同步执行结果至官方客户端服务器；官方客户端服务器综合本机执行结果和代理客户端服务器执行结果发送至调度系统服务器。该方法适用于目标主机不能安装调度管理系统的客户端的情况下，通过代理客户端同时调度不同被控主机，实现同步状态并行调度不同主机作业的目的，相较开发新客户端而言，开发代价小且周期短。