本申请公开了一种用于实现时钟源选取的方法、装置、系统及存储介质，属于时钟技术领域。方法包括：第一节点通过第一节点上的第一端口接收第二节点发送的第一报文；当第一报文携带有第一标记时，第一节点在选取时钟源时，不选取第一端口对应的时钟源，第一标记用于指示第二节点的时间同步不确定。当上游的第二节点的时间同步不确定时，通过在第一报文中携带第一标记，以指示该第二节点的时间同步不确定。通过第一端口接收到携带有第一标记的第一报文后，在选择时钟源时，不使用该第一端口对应的时钟源数据选择时钟源，以此避免因上游节点时间同步不确定而使得下游节点的时间发生跳变，进而影响整网的时间跳变及业务的正常进行。