本申请提出了一种测流数据质量评估方法、装置及应用，对测流仪监测得到的河道的至少一待测水层的测流分层数据进行质量评估，所述方法包括：获取河道数据、测流仪安装数据以及对应至少一水层的至少一测流分层数据；基于所述测流仪安装数据以及所述河道数据，判断待测水层的测流分层数据是否有效，若有效执行步骤S3；基于所述测流分层数据计算得到待测水层的分层自相似性质量因子、分层互相似性质量因子、分层回波强度质量因子、分层噪声质量因子、水位关联性质量因子以及周期性质量因子，基于质量因子评估测流数据的质量，综合考虑外部影响因素以及测流分层数据本身的数据特点，整个测流分层数据的评估涵盖了数据源头以及过程。