本申请公开了一种脑部医疗分析装置以及控制单元，脑部医疗分析装置包括：控制单元，其具有第一选择连接端、第二选择连接端、电极连接端和控制连接端；脑深部电极，其经由延伸导线连接于电极连接端；处理器，其连接于控制连接端，并向控制单元输出控制信号；刺激信号发生单元，其连接于第一选择连接端，并经由脑深部电极输出对脑部进行刺激的电刺激信号；以及信号采集单元，其连接于第二选择连接端，并经由脑深部电极采集脑电信号，控制单元根据控制信号来控制第一选择连接端与电极连接端的接通状态以及第二选择连接端与电极连接端的接通状态。本申请能够方便地对脑部进行电刺激和信号采集，且能够同时进行电刺激和信号采集。