本发明一种MRA脑部图像的自动分析系统包括图像采集模块、第一数据库、信号显示模块、第一处理器，其用于截取出所述第二图像；所述第一处理器判断所述第二图像内的灰度大于第一阈值的封闭图形的个数是否超过一个，若是则输出报警信号为所述第一信号，若否则通过第二方法输出所述第一信号；本发明通过所述第一处理器通过识别封闭图形的个数进而判断脑部图像内的血管是否为相互连通的或者存在，若只存在一个封闭图形则说明脑血管之间连通较好，若存在一个以上的封闭图形则说明脑血管内存在有狭窄或封闭的血管，提高了患者的就医就诊速度。