本发明公开了一种进气多级自预热的新型燃料电池电堆及控制方法，包括：进气歧管，所述进气歧管包括分别设置在电堆内部两侧的阳极气体入口流道和阴极气体入口流道；所述进气歧管外围包围设置冷却液出口流道，形成套管式进气歧管；冷却液与进气流体流动方向相反形成逆流式对流换热。本发明通过在电堆内部对氢氧进气进行多级预热，能够达到不同工况下的进气温度预热目标，不仅减少了进气在电堆外部加热所需装置与功耗，使燃料电池系统更具便携性，且通过对冷却液余热的逐级利用提高了燃料电池的总效率。