本发明公开了一种基于大数据的数据可视化预处理系统，涉及数据可视化领域，其技术方案包括可视化主机，可视化主机的内部包括中央处理系统、数据系统、数据传输模块、深度学习模块和云端存储模块，数据系统的内部包括数据预处理模块、数据处理模块、数据分类模块和数据剔除模块，数据系统对外部的数据进行录入，并对录入的数据进行处理、分析以及剔除，数据系统与数据传输模块之间通信连接，数据处理模块对预处理后的数据进行再次审核，从而对数据的真实性与准确性进行判断，最后通过数据剔除模块对系统中冗杂的数据进行剔除，同时数据剔除模块对数据中具有危害的数据进行剔除，从而保证整体系统的安全性以及运行时的稳定性。