本发明公开了一种磁力驱动分隔内置式波动泵送血液心室血泵，包括泵盖扣合在泵体上形成的泵体组件，泵盖上设有血液出口，泵体内设有内隔板，内隔板将泵体组件内腔分成流动腔和驱动腔，泵体上设有血液进口。导向组件穿过内隔板上的开口在流动腔和驱动腔内贯通，导向组件上套有从动组件，从动组件处于驱动腔的部分嵌固有永磁体而处于流动腔内的部分与介于导向组件与泵盖之间的柔性膜组件连接，驱动腔内安装的磁力驱动组件围绕永磁体设置。在磁力驱动组件的交变磁场作用下，从动组件带动柔性膜组件做振荡运动，使柔性膜沿径向产生波动来对血液实现波动泵送，从而降低溶血、血栓等并发症发生风险，提高血液相容性。