本发明提供一种纸喷雾装置及质谱检测系统，涉及质谱检测技术领域。纸喷雾装置包括：壳体，所述壳体的两端开口，所述壳体的其中一端安装于质谱仪的进样口；电离仓样品盘，所述电离仓样品盘具有多个孔位，所述孔位用于放置电离仓，所述电离仓样品盘可活动地安装于所述壳体内，以调节所述孔位电离仓中基质材料相对于所述进样口的位置；所述电离仓用于放置基质材料。本发明提供的纸喷雾装置及质谱检测系统，便于盛放多个电离仓；通过将电离仓样品盘可活动地安装于壳体内，便于调节每个孔位中的电离仓相对于进样口的位置，有利于切换进样孔位，实现连续进样，节省了更换基质材料的时间，提高了质谱检测效率和准确性。