本发明提供一种从三分三植物中分离纯化东莨菪碱单体的方法，涉及东莨菪碱单体提取分离技术领域。该方法中：将三分三粗粉与溶剂混合，超临界萃取，得到萃取液A，再加入氨水，调节pH至9‑10，用氯仿萃取，得到萃取液B，然后加入稀硫酸反应30‑40min，依次用四氯化碳、氯仿萃取，得到萃取液C，将萃取液C离心，得到上清液，真空干燥，得到残渣；将残渣溶于稀硫酸中，再加入碳酸氢钠溶液调节pH至6.8‑7.3，加热，在50‑60℃放置1‑2d，再加入活性炭反应，经过超滤、浓缩，得到浓缩液，将浓缩液用氯仿萃取1‑3次，合并萃取液，蒸干。通过该方法得到的东莨菪碱含量更多、纯度更高。