本发明涉及一种表面分子印迹凝胶光子晶体传感器及其制备方法和应用，所制备的表面分子印迹凝胶光子晶体传感器可用于目标分子的快速定性、定量检测。本发明以四环素与聚苯乙烯‑丙烯酸(PSA)胶粒同时自组装形成的胶体晶体为模板，丙烯酰胺和衣康酸为双功能单体在胶体晶体间隙中聚合制备出表面分子印迹凝胶光子晶体传感器。所得传感器对目标分子响应较快(<60 s)，布拉格(Bragg)衍射波长随溶液中目标化合物浓度的增加发生红移，并能肉眼观察到明显的颜色变化。红移量(Δλ)与目标分子浓度的负对数(‑logC)呈线性关系，使得该传感器可用于定量检测。本发明提高了分子印迹凝胶光子晶体传感器的灵敏度与检测速度。