本发明公开了一种FBD程序中功能块间的自动连线方法及装置，包括：响应于可视化窗口的连线池中触发的第一目标事件，根据第一目标事件获取待连线的目标功能块；解析目标功能块，获取目标功能块的功能块ID号以及引脚信息；判断是否导入与目标功能块关联的网络关系文件；若是，执行根据网络关系文件中确定的逻辑关系，在目标功能块的引脚与确定关联的功能块的引脚之间添加连线；若否，执行预设的连线规则配置，按照连线需求配置，利用功能块ID号以及引脚信息将目标功能块与连线池中符合要求的其他功能块的引脚之间完成自动连线。本发明省去了手动添加功能块连线的时间，提升组态操作效率；减少了手动连线出错的可能，保证控制逻辑的正确性。