本发明实施例公开了一种点位打卡系统及方法，包括：通行信息配置模块，用于针对各目标人员预先录入与目标人员对应的目标生物信息和目标打卡信息；人员信息采集模块，用于获取采集人员的采集生物信息；人员轨迹构建模块，用于获取采集生物信息和采集时间，将采集生物信息与通行信息配置模块中各目标生物信息匹配确定采集生物信息对应的目标人员；异常通行记录模块，用于在预设时间针对各目标人员从人员轨迹构建模块中获取目标人员的行动轨迹，若根据行动轨迹和通行信息配置模块中与目标人员对应的目标打卡信息确定目标人员存在异常到达，则根据目标人员、异常时间和异常点位生成异常到达记录表，实现提高打卡机动性和实时性，保障安全性的效果。