本发明公开了一种无人船自动靠泊系统，属于无人船靠泊设备技术领域，包括固设在沿岸侧边处的多个顶棚板，所述顶棚板的内部固设有位置调整机构，位置调整机构包括X向调节组件、Y向调节组件以及Z向调节组件，X向调节组件固接在固定架的内侧壁上，固定架固接在顶棚板的内侧壁上，X向调节组件的内侧连接有固定板，固定板的底部与Y向调节组件连接；本发明能够实现无人船精准靠泊，靠泊效果较好，为无人船提供防护效果，安全性高，能够适配各种连接座间距不同的船体使用，适用范围广，能降低海浪对无人船产生多个方向的冲击力，实现船体的柔性靠泊，同时可保证无人船能够安全范围内浮动，不会产生碰撞，适用于多个无人船靠泊，靠泊效率更高。