本发明提供一种基于远程控制的输入窗口的控制方法及系统，其中方法包括：主控端接收用户点击事件并获取点击事件的位置数据，并将所述点击事件的位置数据发送至被控端；所述被控端接收所述位置数据，并根据所述位置数据判断点击事件的位置是否为输入框区域；若点击事件的位置是为输入框区域，则控制鼠标显示图标为工字图标；所述主控端对所述被控端的鼠标显示图标进行实时监控，当监控到被控端的鼠标显示图标为工字图标时，调用本地输入窗口，接收用户输入数据。与现有技术方案相比本申请具有简单便捷易实施且体验效果好的优点。