本发明公开了一种硅改性长链羧基聚醚‑碳酸酯水性聚氨酯的制备方法，包括：以环氧化合物、含双键的环氧单体、二氧化碳为单体，经共聚得到长链双键基聚醚‑碳酸酯多元醇，再经与巯基羧酸类单体进行点击化学制备得到长链羧基型聚醚‑碳酸酯多元醇；将长链羧基型聚醚‑碳酸酯多元醇、二异氰酸酯与多羟基扩链剂混合，经反应制备得到水性聚氨酯预聚物，再经氨基硅烷偶联剂接枝改性以及与水扩链后得到硅改性长链羧基聚醚‑碳酸酯水性聚氨酯。该硅改性长链羧基聚醚‑碳酸酯水性聚氨酯的乳化效率高，具有优异的乳液稳定性；兼具优异的机械性能、耐热性和疏水性。