本发明公开了一种适用于神经性运动障碍患者康复阶段的辅助诊断系统，主要包括具备肌电、肌力信号同步采集功能的硬件系统和基于深度学习算法的神经性运动障碍患者辅助诊断方法。其中，所述硬件系统包括：具备肌电信号采集功能的传感器模块、具备肌力信号检测的传感器模块、信号处理模块。本发明利用肌力信号确定臂环与皮肤的接触状态，对肌电信号进行预校准，并使用肌力信号对肌电信号进行匹配和修正，明确对应肌肉群的肌电信号通道编号。将患者健侧和患侧同步采集到的信号经过数据分析处理后进行健患侧差异特征提取，选取与疾病康复强关联的特征作为数据集，输入进神经网络进行模型训练，对神经性运动障碍患者的康复情况进行诊断，助力医疗物联网建设。本发明的辅助诊断系统具有体积小、便携、操作简单、准确率高等特点。