本发明涉及计算机技术领域，提供一种企业客户端的应用检测方法、系统、电子设备和存储介质。应用检测方法包括：部署于企业客户端的应用检测服务对企业客户端上部署的应用进行检测，包括：获得检测任务数据，检测任务数据携带至少一个应用标识，每个应用标识携带至少一个检测项标识；根据各应用标识携带的检测项标识，依次调用对应的检测项，对各应用标识对应的应用进行检测，并将检测结果数据提交至后台接口；后台接口根据检测结果数据，获得企业客户端的各应用标识对应的应用的运行状态。本发明能够通过应用检测服务覆盖所有的检测功能，并能够实现一次下发持续使用，自动持续进行相关应用的检测，简化检测方式，降低人力运维成本。