本申请涉及一种环肽设计方法、复合物结构的生成方法、装置及电子设备。该设计方法包括：获取包含热点残基和靶点蛋白的初始复合物结构；沿初始复合物结构的热点残基的N端和/或C端新增氨基酸，获得长度不超过预设长度阈值的线性肽，并根据对应的线性肽中的热点残基的初始骨架二面角进行环肽构象搜索，筛选获得符合预设环肽条件的候选环肽构象；分别对各候选环肽构象及序列进行优化，获得对应的优化环肽构象及优化环肽构象对应的环肽序列；在优化环肽构象中进行筛选，确定P_near值大于预设阈值的目标环肽序列。本申请提供的方案，从头设计出能够靶向结合的环肽分子，增加了环肽构象及环肽序列的多样性，为环肽的成药性提供更多可靠的选择。