本发明公开了一种医用回旋加速器退役源项调查方法，其包括以下步骤：利用Monte Carlo方法计算中子分布，获得中子分布情况；根据中子分布情况设置采样点的位置；将各个采样点的位置输入到Monte Carlo软件中，获得理论计算的各个采样点的放射性核素种类和比活度，根据各个采样点的位置进行采样，再根据采样结果进行放射性核素化学分析、获得实际采样点的放射性核素种类和比活度；将两种方法获得的放射性核素种类和比活度结果进行对比，并且不断用理论计算结果校正实际采样点的位置和比活度；本发明通过理论计算和实测相结合的方法，最终分析出特殊的关键点和切割范围，使得上百吨重量的加速器最后切割出的高放射性废物只有几十公斤甚至几公斤。