本发明涉及一种AR多窗口全息交互方法及系统，该方法包括如下步骤：获取终端设备的应用数据并将所述终端设备上的所有的应用通过AR眼镜在固定区域进行显示；接收用户对所述固定区域所显示的画面的操作动作，并将所接收的操作动作反馈给终端设备进行执行；将所述终端设备的执行结果通过所述AR眼镜在所述固定区域的上方以悬浮窗口的方式予以显示，所述悬浮窗口至少有两个，且每一悬浮窗口可对应显示一个应用。本发明的交互方法将终端设备上的操作及应用通过AR眼镜在空间中全息呈现和交互，且通过悬浮窗口可支持多个应用渲染画面同时在空间中开窗显示，实现了在现实空间中支持多个窗口进行显示和交互。